David Eben wurde 1965 in Prag geboren. In den Jahren 1981-1986 studiert er Klarinette am Prager Konservatorium. 1991 schliesst er an der Philosophischen Fakultät der Karlsuniversität in Prag das Studium der Musikwissenschaft ab. Bereits während seines Studiums konzentriert er sich auf das Gebiet der mittelalterlichen Musik, vor allem den gregorianischen Choral. In den Jahren 1990-1991 absolviert er am Pariser Konservatorium (Conservatoire Nationale Supérieur de Musique de Paris) das Fach "Dirigieren des gregorianischen Chores" und ist während einer Saison als Dirigent des "Choeur Grégorien de Paris" tätig. Während seines Aufenthalts in Frankreich besucht er zu Forschungszwecken oft die Abtei Solesmes. Seit 1993 unterrichtet er am Musikwissenschaftlichen Institut der Karlsuniversität in Prag. Im Jahre 2003 schliesst er seine Dissertation über Antiphonen des Offiziums ab. 2007 erhält er die Habilitation für Theorie und Praxis des gregorianischen Chorals an der Akademie der musischen Künste in Prag (Musikhochschule).

Parallel zu seiner Arbeit auf dem Gebiet der Musikwissenschaft konzentriert sich David Eben auf die Interpretation des gregorianischen Chorals. Im Jahre 1987 gründet er das Ensemble Schola Gregoriana Pragensis, das zahlreiche Aufnahmen realisierte und zu Konzerten in fast alle Länder Europas sowie nach Israel und Japan eingeladen wurde. Zurzeit unterrichtet er als Assistenzprofessor für Gregorianik an der Universität Luzern. Er leitet regelmässig Kurse für Gregorianik in der Schweiz, in Frankreich und Belgien.